Subject

Обработка на податоци

1. Course Title Обработка на податоци
Data processing
2. Code BI-I-02
3. Study Programme Биоинформатика
4. Organizer of the study programme (unit, institute, department or division) Faculty of Computer Science and Engineering
5. Degree level (first, second, third cycle) Second cycle
6. Academic year / semester 10 / Summer
7. Number of ECTS credits 6
8. Teacher Илинка Иваноска, Слободан Калајџиски
9. Prerequisites for enrolling in the course
10. Objectives of the course programme (competences) Овој курс првенствено ќе се фокусира на развој на вештини потребни за поддршка на останатите курсеви во програмата. Додека го изучуваат овој курс, студентите ќе развијат систематско разбирање на принципите на компјутерската наука и науката за податоци, кои се во темелите на многу интердисциплинарни програми. На студентите ќе им се понуди широко знаење во клучните области на компјутерски науки релевантни за современите истражувања, вклучувајќи ја и способноста да се евалуираат податоци и да се идентификуваат соодветни алатки за нивно испитување и манипулација. Со овој курс студентите ќе се здобијат со следните компетенции:
- Knowledge of the key elements of advanced programming in scientific research
- Knowledge of the key elements of modern scripting and analytical languages (such as, but not limited to, R and Python)
o манипулација со податоци
o основни процедури за анализа на податоци
o креирање графикони
- Knowledge of approaches and methods for visualizing complex data using modern scripting languages.
- Собирање, извлекување и манипулација на големи податочни множества користејќи командна линија и алатки за скриптирање.
- Designing, writing, annotating, testing and debugging analytical code.
- Designing, justifying and implementing a computational workflow for data processing that includes multiple computing tools for examining outcome-oriented research questions.
11. Course content Курсот ќе биде изграден од четири тематски области:
1. Напредни системски вештини за најразлични интердисциплинарни студии (Linux)
2. Вовед во R
3. Вовед во Python
4. Претпроцесирање и чистење на податоци
5. Методи за визуелизација на податоци
12. Learning methods Предавања поддржани со презентации преку слајдови, интерактивни предавања, вежби (користење на опрема и софтверски пакети), тимска работа, пример случаи, поканети гости предавачи, самостојна изработка и одбрана на проектна задача и семинарска работа, учење во електронско опкружување (форуми, консултации).
13. Total available time 6 ECTS x 30 hours = 180 hours
14. Distribution of available time 60 + 0 + 45 + 45 + 30 = 180 hours
15. Forms of teaching activities
15.1. Lectures - theoretical instruction 60 hours
15.2. Exercises (laboratory, auditory), seminars, teamwork 0 hours
16. Other forms of activities
16.1. Project assignments 45 hours
16.2. Independent assignments 45 hours
16.3. Home study 30 hours
17. Assessment method
17.1. Tests 15 бодови
17.2. Seminar paper / project (presentation: written and oral) 45 points
17.3. Activities and learning 15 бодови
17.4. Final exam 0 points
18. Grading criteria (points / grade)
up to 50 points5 (five) (F)
from 51 to 60 points6 (six) (E)
from 61 to 70 points7 (seven) (D)
from 71 to 80 points8 (eight) (C)
from 81 to 90 points9 (nine) (B)
from 91 to 100 points10 (ten) (A)
19. Requirement for obtaining a signature and taking the final exam реализирани активности 15
20. Language of instruction Macedonian and English
21. Method for monitoring the quality of teaching internal evaluation and survey mechanism
22. Literature
22.1. Required literature
1. Vince Buffalo | Bioinformatics Data Skills | O`Reilly Media | 2015
2. Steven Haddock, Casey Dunn | Practical Computing for Biologists | Oxford University Press | 2011
3.
22.2. Additional literature
No. Author Title Publisher Year